全国共有1:100万比例尺地形图77幅。该数据库利用1:100万比例尺分版二底图正片作为数据源，执行了《国土基础信息数据分类与编码》(GB/T 13923-92)国家标准。
国家基础地理信息系统数据库属性代码分为两类：分类码和标识码。
分类码由6位字符组成，用以标志数据要素类型诸如国界，省界，区界，或县界等信息。其结构如下：
以下是几种要素的分类码示例：
| 首都 | 31010 |
| 省(自治区、直辖市)驻地 | 31020 |
| 地区(自治州、盟)驻地 | 31040 |
| 县(自治县、旗)驻地 | 31060 |
| 乡驻地 | 31090 |
标识码一般由6位字符组成，用于一个个地标记主要要素，如县以上居民地、县级以上境界、主要河流、湖泊、国道等。
不同类型要素的标识码结构不同。例如中华人民共和国行政区划代码的结构为：
以下是几个县以上城市的行政区划代码示例：
广东省 440000
广东省广州市 440100
广东省广州市从化县 440122
国家基础地理信息系统中上述两种代码系统均执行中国国家标准，以保证与国家标准的一致。